MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis HD-771 plasmid p08

Total Repeats: 104

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018490	CAT	2	6	53	58	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_018490	T	6	6	70	75	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018490	ATT	2	6	101	106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018490	CAA	2	6	121	126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018490	CACT	2	8	142	149	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018490	ATC	2	6	173	178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018490	TTCTT	2	10	231	240	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_018490	A	7	7	260	266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018490	CCT	2	6	268	273	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_018490	A	6	6	356	361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018490	TA	3	6	371	376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_018490	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018490	TA	3	6	393	398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018490	ATA	2	6	403	408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_018490	CAC	2	6	424	429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018490	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_018490	A	7	7	492	498	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_018490	A	7	7	504	510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_018490	TA	3	6	1108	1113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_018490	T	6	6	1173	1178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_018490	A	6	6	1179	1184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018490	T	6	6	1197	1202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018490	A	6	6	1327	1332	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018490	A	6	6	1346	1351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018490	TAAA	2	8	1358	1365	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018490	CTT	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_018490	TTTCCA	2	12	1398	1409	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018490	AT	3	6	1463	1468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018490	CTT	2	6	1478	1483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_018490	TCT	2	6	1525	1530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018490	TA	3	6	1553	1558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_018490	GC	3	6	1625	1630	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_018490	T	6	6	1713	1718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018490	AT	3	6	1734	1739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018490	TCT	2	6	1747	1752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_018490	CTG	2	6	1807	1812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018490	CATTT	2	10	1814	1823	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_018490	T	7	7	1827	1833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_018490	ATTA	2	8	1932	1939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018490	AATC	2	8	1943	1950	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_018490	TAT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018490	A	6	6	2062	2067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_018490	T	7	7	2135	2141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_018490	T	6	6	2181	2186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_018490	AGA	2	6	2189	2194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_018490	A	7	7	2222	2228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_018490	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_018490	T	7	7	2380	2386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_018490	A	6	6	2393	2398	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_018490	T	8	8	2409	2416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_018490	A	7	7	2471	2477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_018490	TATT	2	8	2543	2550	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_018490	TGG	2	6	2554	2559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_018490	T	7	7	2574	2580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_018490	A	6	6	2640	2645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_018490	TAAAA	2	10	2658	2667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_018490	T	7	7	2684	2690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_018490	ATG	2	6	2785	2790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_018490	GTA	2	6	2848	2853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_018490	TAAAA	2	10	2858	2867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_018490	A	8	8	2864	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_018490	T	7	7	2914	2920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_018490	AAT	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_018490	GCT	2	6	2946	2951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_018490	TCA	2	6	2964	2969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_018490	CTT	2	6	2974	2979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_018490	ACA	2	6	3008	3013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_018490	A	7	7	3066	3072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_018490	TA	3	6	3092	3097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_018490	A	7	7	3203	3209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_018490	AAT	2	6	3229	3234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_018490	TA	3	6	3253	3258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018490	T	8	8	3540	3547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018490	T	6	6	3564	3569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018490	TAT	2	6	3582	3587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018490	TACAA	2	10	3602	3611	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_018490	ATA	2	6	3621	3626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_018490	ATA	2	6	3782	3787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_018490	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_018490	AATTA	2	10	4841	4850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_018490	AT	3	6	4873	4878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_018490	TTC	2	6	4919	4924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_018490	GAA	2	6	4933	4938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_018490	AAAC	2	8	7328	7335	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_018490	ACC	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_018490	A	6	6	7737	7742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_018490	TATTAA	2	12	7759	7770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_018490	ACT	2	6	7786	7791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_018490	A	6	6	7800	7805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_018490	T	7	7	7808	7814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_018490	AAT	3	9	7823	7831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_018490	TAA	2	6	7836	7841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_018490	CAA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_018490	TTA	2	6	7888	7893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_018490	TGCA	2	8	7932	7939	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_018490	T	7	7	7964	7970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_018490	TAA	2	6	8006	8011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_018490	TCT	2	6	8098	8103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_018490	A	7	7	8127	8133	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_018490	TAA	2	6	8138	8143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_018490	AAC	2	6	8177	8182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_018490	ATA	2	6	8186	8191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_018490	TTC	2	6	8199	8204	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_018490	TTTA	2	8	8527	8534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.